Alien Trilogy lấy nhiều yếu tố từ loạt phim Aliens, như bầy quái vật đặc trưng của phim gồm face hugger, chest burster, dog alien, adult alien và Queen alien. Game có tổng cộng 30 màn chơi và ba con trùm Queen alien. Cùng sự hiện diện của nhiều loại vũ khí gồm súng trường xung điện từ Aliens và các trang thiết bị khác, chẳng hạn như đèn chiếu sáng gắn trên vai mà người chơi có thể dùng được. Các phiên bản console chỉ có mỗi phần chiến dịch chơi đơn trong khi phiên bản DOS còn có thêm mục chơi nối mạng nhiều người theo thể thức deathmatch.